DNA Nanotechnology for Application in Targeted Protein Degradation
Source abstract
Abstract
DNA is a kind of flexible and versatile biomaterial for constructing nanostructures and nanodevices. Due to high biocompatibility and programmability and easy modification and fabrication, DNA nanotechnology has emerged as a powerful tool for application in intracellular targeted protein degradation. In this review, we summarize the recent advances in the design and mechanism of targeted protein degradation technologies such as protein hydrolysis targeted chimeras, lysosomal targeted chimeras, and autophagy based protein degradation. Subsequently, we introduce the DNA nanotechnologies of DNA cascade circuits, DNA nanostructures, and dynamic machines. Moreover, we present the latest developments in DNA nanotechnologies in targeted protein degradation. Finally, the vision and challenges are discussed.
Source: openalex_inverted_index · Quality: baseline
Research context
OpenAlex topics: Advanced biosensing and bioanalysis techniques · RNA Interference and Gene Delivery · Molecular Junctions and Nanostructures
SciVX discovery tags are terminology-based. OpenAlex topics are source-provided classifications.
Affiliations
School of Chemistry and Chemical Engineering
Nanjing University of Science and Technology
School of Environmental and Biological Engineering
Funding
Fundamental Research Funds for the Central Universities · National Natural Science Foundation of China · Program of Jiangsu Specially-Appointed Professor
References (100+)
Show source-provided references
1. 10.1016/j.bbamcr.2013.06.03110.1016/j.bbamcr.2013.06.031 ↗
2. 10.1039/C7AN00338B10.1039/C7AN00338B ↗
3. 10.1016/j.tibs.2019.01.00710.1016/j.tibs.2019.01.007 ↗
4. 10.1016/j.tcb.2019.07.00110.1016/j.tcb.2019.07.001 ↗
5. 10.1038/nrc389310.1038/nrc3893 ↗
6. 10.1182/blood.202000967610.1182/blood.2020009676 ↗
7. 10.1002/jcp.2924810.1002/jcp.29248 ↗
8. 10.1016/j.bmcl.2008.07.11410.1016/j.bmcl.2008.07.114 ↗
9. 10.1101/cshperspect.a00437410.1101/cshperspect.a004374 ↗
10. 10.1016/j.cbpa.2019.02.02210.1016/j.cbpa.2019.02.022 ↗
11. 10.1038/s41401-024-01364-y10.1038/s41401-024-01364-y ↗
12. 10.1016/j.chembiol.2022.08.00410.1016/j.chembiol.2022.08.004 ↗
13. 10.1016/j.omto.2022.10.01210.1016/j.omto.2022.10.012 ↗
14. 10.1016/j.tips.2020.04.00510.1016/j.tips.2020.04.005 ↗
15. 10.1002/anie.20190992710.1002/anie.201909927 ↗
16. 10.1016/j.copbio.2013.12.01110.1016/j.copbio.2013.12.011 ↗
17. 10.1016/j.jbc.2021.10064710.1016/j.jbc.2021.100647 ↗
18. 10.1016/j.scib.2024.03.05610.1016/j.scib.2024.03.056 ↗
19. 10.1073/pnas.14123079810.1073/pnas.141230798 ↗
20. 10.1186/s13045-020-00885-310.1186/s13045-020-00885-3 ↗
21. 10.1042/BCJ2016071910.1042/BCJ20160719 ↗
22. 10.1016/j.ejmech.2018.01.06310.1016/j.ejmech.2018.01.063 ↗
23. 10.1021/acsmedchemlett.9b0058410.1021/acsmedchemlett.9b00584 ↗
24. 10.1039/D2CS00193D10.1039/D2CS00193D ↗
25. 10.1073/pnas.180366211510.1073/pnas.1803662115 ↗
26. 10.1016/j.bioorg.2023.10690810.1016/j.bioorg.2023.106908 ↗
27. 10.1016/j.biotechadv.2015.10.00410.1016/j.biotechadv.2015.10.004 ↗
28. 10.1038/s41589-021-00770-110.1038/s41589-021-00770-1 ↗
29. 10.1080/15548627.2019.160354710.1080/15548627.2019.1603547 ↗
30. 10.1039/D1CC04661F10.1039/D1CC04661F ↗
31. 10.1080/15548627.2019.168855610.1080/15548627.2019.1688556 ↗
32. Chen K. · Current Biotechnology · 2022 · 12 · 352
33. Zhao X. · Biochemistry and Biophysical Progress · 2019 · 46 · 533
34. 10.3389/fchem.2023.113486310.3389/fchem.2023.1134863 ↗
35. 10.1073/pnas.040702410110.1073/pnas.0407024101 ↗
36. 10.1039/C8CS00402A10.1039/C8CS00402A ↗
37. 10.1021/jacsau.2c0029210.1021/jacsau.2c00292 ↗
38. 10.1021/ac403726210.1021/ac4037262 ↗
39. 10.1021/jacs.5b0177810.1021/jacs.5b01778 ↗
40. 10.1038/nmeth.461110.1038/nmeth.4611 ↗
41. 10.1038/s41596-021-00621-210.1038/s41596-021-00621-2 ↗
42. 10.1039/D1AN01371H10.1039/D1AN01371H ↗
43. 10.1038/nature0645110.1038/nature06451 ↗
44. 10.1016/j.trac.2023.11750810.1016/j.trac.2023.117508 ↗
45. 10.1002/smll.20190298910.1002/smll.201902989 ↗
46. 10.1002/anie.20170354010.1002/anie.201703540 ↗
47. 10.1016/j.aca.2019.10.05110.1016/j.aca.2019.10.051 ↗
48. 10.1021/acs.chemrev.9b0012110.1021/acs.chemrev.9b00121 ↗
49. 10.1016/j.aca.2020.01.03410.1016/j.aca.2020.01.034 ↗
50. 10.1039/C5NR01405K10.1039/C5NR01405K ↗
51. 10.1021/jacs.2c0200910.1021/jacs.2c02009 ↗
52. 10.1021/ja906475w10.1021/ja906475w ↗
53. 10.1016/j.chempr.2020.12.00110.1016/j.chempr.2020.12.001 ↗
54. 10.1038/350631a010.1038/350631a0 ↗
55. 10.1021/jacs.0c0196210.1021/jacs.0c01962 ↗
56. 10.1038/s41467-022-32261-910.1038/s41467-022-32261-9 ↗
57. 10.1126/science.112036710.1126/science.1120367 ↗
58. 10.1002/smll.20220471110.1002/smll.202204711 ↗
59. 10.1016/j.nantod.2023.10212710.1016/j.nantod.2023.102127 ↗
60. 10.1021/acssensors.8b0025710.1021/acssensors.8b00257 ↗
61. 10.1038/s41596-020-0355-z10.1038/s41596-020-0355-z ↗
62. 10.1002/adma.20231176010.1002/adma.202311760 ↗
63. 10.1002/sstr.20220037610.1002/sstr.202200376 ↗
64. 10.1038/nature0458610.1038/nature04586 ↗
65. 10.1038/nature0801610.1038/nature08016 ↗
66. 10.1002/adma.20230103510.1002/adma.202301035 ↗
67. 10.1038/s41578-022-00517-x10.1038/s41578-022-00517-x ↗
68. 10.1021/acs.chemrev.9b0029110.1021/acs.chemrev.9b00291 ↗
69. 10.1002/advs.20220032710.1002/advs.202200327 ↗
70. 10.1021/jacs.5b0552210.1021/jacs.5b05522 ↗
71. 10.1126/science.aan655810.1126/science.aan6558 ↗
72. 10.1021/acs.analchem.1c0176510.1021/acs.analchem.1c01765 ↗
73. 10.1021/acssensors.0c0151110.1021/acssensors.0c01511 ↗
74. 10.1038/ncomms910210.1038/ncomms9102 ↗
75. 10.1002/ange.20161177710.1002/ange.201611777 ↗
76. 10.1038/nnano.2015.25910.1038/nnano.2015.259 ↗
77. 10.1002/anie.20190127210.1002/anie.201901272 ↗
78. 10.1039/D0CC00017E10.1039/D0CC00017E ↗
79. 10.1016/j.foodcont.2024.11057310.1016/j.foodcont.2024.110573 ↗
80. 10.1016/j.talanta.2024.12614310.1016/j.talanta.2024.126143 ↗
81. 10.1021/acs.analchem.4c0046210.1021/acs.analchem.4c00462 ↗
82. 10.1021/acs.analchem.4c0066410.1021/acs.analchem.4c00664 ↗
83. 10.1038/nnano.2015.27810.1038/nnano.2015.278 ↗
84. 10.1021/acssynbio.3c0047410.1021/acssynbio.3c00474 ↗
85. 10.1038/s41563-024-01826-y10.1038/s41563-024-01826-y ↗
86. 10.1038/s41563-024-01865-510.1038/s41563-024-01865-5 ↗
87. 10.1038/nbt.407110.1038/nbt.4071 ↗
88. 10.1038/s41563-020-0793-610.1038/s41563-020-0793-6 ↗
89. 10.1016/j.mattod.2018.08.00210.1016/j.mattod.2018.08.002 ↗
90. 10.1021/jacs.3c0084810.1021/jacs.3c00848 ↗
91. 10.1126/sciadv.adn942310.1126/sciadv.adn9423 ↗
92. 10.1016/j.xinn.2023.10041310.1016/j.xinn.2023.100413 ↗
93. 10.1002/smll.20220777810.1002/smll.202207778 ↗
94. 10.1016/j.chembiol.2021.04.01110.1016/j.chembiol.2021.04.011 ↗
95. 10.1038/nprot.2010.6610.1038/nprot.2010.66 ↗
96. 10.1016/j.trac.2019.05.02710.1016/j.trac.2019.05.027 ↗
97. 10.1002/cphc.20190084410.1002/cphc.201900844 ↗
98. 10.1021/acsami.0c2027710.1021/acsami.0c20277 ↗
99. 10.1002/anie.20210734710.1002/anie.202107347 ↗
100. 10.1002/advs.20240162310.1002/advs.202401623 ↗