journal article·2015-12-02

Crystallographic and Computational Study on Cationic Triply Hydrogen-Bonded Nucleobases without Direct Anionic Stabilization

Alba Vellé, Andrea Cebollada, Silvia Ruiz, Célia Fonseca Guerra, Pablo J. Sanz Miguel

Crystal Growth & Design· Volume 15· Issue 12
Publisher page

Abstract

[(1MeCH)(1MeC)](I 3 )·2H 2 O (1MeC = 1-methylcytosine) ( 1 ) displays a single hemicytosinium i-motif, which is surrounded by four water molecules and interestingly does not exhibit direct interactions with anions. Quantum chemical calculations in water (SMD solvent model) reproduce accurately the geometry of the “water-submerged” cation 1 . Furthermore, we performed stabilization and proton transfer studies, as well as an evaluation and rationalization of the influence of surrounding molecules enclosing lone electron pairs on triply hydrogen-bond connected nucleobases.
Source: openalex_inverted_index · Quality: baseline

Research context

OpenAlex topics: DNA and Nucleic Acid Chemistry · Advanced biosensing and bioanalysis techniques · Metal complexes synthesis and properties

SciVX discovery tags are terminology-based. OpenAlex topics are source-provided classifications.

Affiliations

Departamento de Química Inorgánica, Instituto de Síntesis Química y Catálisis Homogénea (ISQCH), Universidad de Zaragoza-CSIC, 50009 Zaragoza, Spain

Department of Theoretical Chemistry and Amsterdam Center for Multiscale Modeling (ACMM), VU University Amsterdam, 1081 HV Amsterdam, The Netherlands

Funding

Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek · Universidad de Zaragoza · Ministerio de Econom??a y Competitividad

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