Molecular conformations of DNA targets captured by model nanoarrays
Source abstract
Abstract
An open question in single molecule nanoarrays is how the chemical and morphological heterogeneities of the solid support affect the properties of biomacromolecules. We generated arrays that allowed individually-resolvable DNA molecules to interact with tailored surface heterogeneities and revealed how molecular conformations are impacted by surface interactions.
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Research context
OpenAlex topics: Advanced biosensing and bioanalysis techniques · Molecular Junctions and Nanostructures · Nanofabrication and Lithography Techniques
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Affiliations
Chemistry and Chemical Biology
University of California
Merced
USA
Biological Engineering and Small-scale Technologies
Funding
Division of Materials Research, National Science Foundation · National Aeronautics and Space Administration
References (57)
Show source-provided references
1. Howorka · Soft Matter · 2014 · 7 · 93110.1039/c3sm52561a ↗
2. Fazio · Langmuir · 2008 · 18 · 1052410.1021/la801762h ↗
3. Drmanac · Science · 2010 · 5961 · 7810.1126/science.1181498 ↗
4. Cerf · ACS Nano · 2012 · 9 · 792810.1021/nn3023624 ↗
5. Levy-Sakin · ACS Nano · 2014 · 1 · 1410.1021/nn4050694 ↗
6. Rao · Biomater. Sci. · 2014 · 4 · 43610.1039/C3BM60181A ↗
7. Wirth · Anal. Chem. · 1998 · 24 · 526410.1021/ac980632s ↗
8. Weltz · ACS Nano · 2015 · 1 · 730
9. Langdon · ACS Appl. Mater. Interfaces · 2015 · 6 · 360710.1021/am507730k ↗
10. Rao · Anal. Chem. · 2012 · 24 · 1062810.1021/ac3019334 ↗
11. Nelson · Langmuir · 2015 · 22 · 609910.1021/acs.langmuir.5b01251 ↗
12. Palma · J. Am. Chem. Soc. · 2011 · 20 · 765610.1021/ja201031g ↗
13. Sassolas · Chem. Rev. · 2008 · 1 · 10910.1021/cr0684467 ↗
14. Josephs · J. Am. Chem. Soc. · 2010 · 30 · 1023610.1021/ja1039677 ↗
15. J. N. Israelachvili , Intermolecular and surface forces, Academic Press, San Diego, USA, 2015
16. Qin · Nat. Prot. · 2010 · 3 · 49110.1038/nprot.2009.234 ↗
17. Salaita · Nat. Nanotechnol. · 2007 · 3 · 14510.1038/nnano.2007.39 ↗
18. Vezenov · J. Am. Chem. Soc. · 1997 · 8 · 200610.1021/ja963375m ↗
19. Peterson · Nucleic Acids Res. · 2001 · 24 · 516310.1093/nar/29.24.5163 ↗
20. Gong · Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. · 2008 · 14 · 530110.1073/pnas.0709416105 ↗
21. Fan · Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. · 2003 · 16 · 913410.1073/pnas.1633515100 ↗
22. Wang · Biophys. Chem. · 1992 · 2 · 11710.1016/0301-4622(92)80027-3 ↗
23. Monserud · ACS Nano · 2014 · 5 · 448810.1021/nn4064874 ↗
24. Herne · J. Am. Chem. Soc. · 1997 · 38 · 891610.1021/ja9719586 ↗
25. Drummond · Nat. Biotechnol. · 2003 · 10 · 119210.1038/nbt873 ↗
26. Rant · Nano Lett. · 2009 · 4 · 129010.1021/nl8026789 ↗
27. Murphy · J. Am. Chem. Soc. · 2009 · 11 · 404210.1021/ja808696p ↗
28. Chen · Langmuir · 2009 · 9 · 505410.1021/la804021t ↗
29. Demers · Science · 2002 · 5574 · 183610.1126/science.1071480 ↗
30. Josephs · ACS Nano · 2013 · 4 · 365310.1021/nn400659m ↗
31. Cao · ACS Nano · 2015 · 11 · 1143910.1021/acsnano.5b05546 ↗
32. Macazo · Langmuir · 2015 · 2 · 86810.1021/la504083c ↗
33. Yang · Anal. Chem. · 2014 · 10 · 465710.1021/ac500029z ↗
34. Liu · Annu. Rev. Phys. Chem. · 2008 · 59 · 36710.1146/annurev.physchem.58.032806.104542 ↗
35. Doni · Nanoscale · 2013 · 20 · 998810.1039/c3nr01799k ↗
36. Liu · Langmuir · 2005 · 21 · 197210.1021/la047586d ↗
37. Mirmomtaz · Nano Lett. · 2008 · 12 · 413410.1021/nl802722k ↗
38. Abel · J. Am. Chem. Soc. · 2013 · 17 · 639910.1021/ja401036t ↗
39. Woo · Nat. Commun. · 2014 · 5 · 561010.1038/ncomms6610 ↗
40. Josephs · J. Am. Chem. Soc. · 2010 · 30 · 1023610.1021/ja1039677 ↗
41. Abel · Chem. Commun. · 2014 · 50 · 813110.1039/C4CC02900C ↗
42. Rivetti · J. Mol. Biol. · 1996 · 5 · 91910.1006/jmbi.1996.0687 ↗
43. Hansma · Biophys. J. · 1996 · 4 · 193310.1016/S0006-3495(96)79757-6 ↗
44. Rouzina · J. Phys. Chem. · 1996 · 23 · 997710.1021/jp960458g ↗
45. Grønbech-Jensen · Phys. Rev. Lett. · 1997 · 12 · 247710.1103/PhysRevLett.78.2477 ↗
46. Kang · Anal. Chem. · 2001 · 6 · 109110.1021/ac0013599 ↗
47. Josephs · J. Am. Chem. Soc. · 2012 · 24 · 1002110.1021/ja3010946 ↗
48. Josephs · Nano Lett. · 2012 · 10 · 525510.1021/nl3024356 ↗
49. Kakiuchi · Langmuir · 2000 · 16 · 539710.1021/la991358f ↗
50. Jing · Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. · 1998 · 14 · 804610.1073/pnas.95.14.8046 ↗
51. Tanaka · Nat. Nanotechnol. · 2009 · 8 · 51810.1038/nnano.2009.155 ↗
52. Sternberg · Nature · 2014 · 7490 · 6210.1038/nature13011 ↗
53. Bensimon · Science · 1994 · 5181 · 209610.1126/science.7522347 ↗
54. Matsuoka · Nano Lett. · 2012 · 12 · 648010.1021/nl304063f ↗
55. Sun · J. Am. Chem. Soc. · 2009 · 37 · 1324810.1021/ja906475w ↗
56. Kershner · Nat. Nanotechnol. · 2009 · 9 · 55710.1038/nnano.2009.220 ↗
57. Aghebat Rafat · Angew. Chem., Int. Ed. · 2014 · 29 · 766510.1002/anie.201403965 ↗