journal article·2013-01-08

Controlling and Monitoring Orientation of DNA Nanoconstructs on Lipid Surfaces

Erik P. Lundberg, Bobo Feng, Amir Saeid Mohammadi, L. Marcus Wilhelmsson, Bengt Nordén

Langmuir· Volume 29· Issue 1
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Abstract

Its extraordinary self-assembly property, with potential to form nonperiodic structures with unique addressability, makes DNA ideal for fabrication of advanced nanostructures. We here demonstrate the controllable tethering of a hexagonal DNA nanostructure in two distinct orientations at the lipid bilayer of a liposome functioning as a soft-matter support. With polarized light (linear dichroism) applied to the flow-aligned liposomes, we show that the construct is preferentially in a parallel alignment with the lipid surface when two anchors are attached while with one anchor only a perpendicular orientation is observed.
Source: openalex_inverted_index · Quality: baseline

Research context

OpenAlex topics: Advanced biosensing and bioanalysis techniques · RNA Interference and Gene Delivery · DNA and Nucleic Acid Chemistry

SciVX discovery tags are terminology-based. OpenAlex topics are source-provided classifications.

Affiliations

Department of Chemical and Biological Engineering/Physical Chemistry, Chalmers University of Technology, SE-41296 Gothenburg, Sweden

References (82)

Show source-provided references
1. Winfree E. · Nature · 1998 · 394 · 53910.1038/28998 ↗
2. Ding B. · J. Am. Chem. Soc. · 2004 · 126 · 1023010.1021/ja047486u ↗
3. Liu D. · J. Am. Chem. Soc. · 2004 · 126 · 232410.1021/ja031754r ↗
4. He Y. · J. Am. Chem. Soc. · 2005 · 127 · 1220210.1021/ja0541938 ↗
5. Liu Y. · J. Am. Chem. Soc. · 2005 · 127 · 1714010.1021/ja055614o ↗
6. Lund K. · J. Am. Chem. Soc. · 2005 · 127 · 1760610.1021/ja0568446 ↗
7. Park S. H. · Angew. Chem. · 2006 · 45 · 73510.1002/anie.200503797 ↗
8. Tumpane J. · Nano Lett. · 2007 · 7 · 383210.1021/nl072512i ↗
9. Lundberg E. P. · ACS Nano · 2011 · 5 · 756510.1021/nn202568q ↗
10. Chen J. H. · Nature · 1991 · 350 · 63110.1038/350631a0 ↗
11. Zhang Y. · J. Am. Chem. Soc. · 1994 · 116 · 166110.1021/ja00084a006 ↗
12. Goodman R. P. · Science · 2005 · 310 · 166110.1126/science.1120367 ↗
13. Aldaye F. A. · Angew. Chem. · 2006 · 45 · 220410.1002/anie.200502481 ↗
14. He Y. · Nature · 2008 · 452 · 19810.1038/nature06597 ↗
15. Oliveira C. L. · ACS Nano · 2010 · 4 · 136710.1021/nn901510v ↗
16. Mao C. · Nature · 1999 · 397 · 14410.1038/16437 ↗
17. Yurke B. · Nature · 2000 · 406 · 60510.1038/35020524 ↗
18. Yan H. · Nature · 2002 · 415 · 6210.1038/415062a ↗
19. Yin P. · Angew. Chem. · 2004 · 43 · 490610.1002/anie.200460522 ↗
20. Green S. J. · Biophys. J. · 2006 · 91 · 296610.1529/biophysj.106.084681 ↗
21. Lund K. · Nature · 2010 · 465 · 20610.1038/nature09012 ↗
22. Adleman L. M. · Science · 1994 · 266 · 102110.1126/science.7973651 ↗
23. Braich R. S. · Science · 2002 · 296 · 49910.1126/science.1069528 ↗
24. Stojanovic M. N. · Nat. Biotechnol. · 2003 · 21 · 106910.1038/nbt862 ↗
25. Stojanovic M. N. · J. Am. Chem. Soc. · 2005 · 127 · 691410.1021/ja043003a ↗
26. Barish R. D. · Nano Lett. · 2005 · 5 · 258610.1021/nl052038l ↗
27. Seelig G. · Science · 2006 · 314 · 158510.1126/science.1132493 ↗
28. Qian L. · Nature · 2011 · 475 · 36810.1038/nature10262 ↗
29. Rothemund P. W. · Nature · 2006 · 440 · 29710.1038/nature04586 ↗
30. Shih W. M. · Nature · 2004 · 427 · 61810.1038/nature02307 ↗
31. Andersen E. S. · ACS Nano · 2008 · 2 · 121310.1021/nn800215j ↗
32. Andersen E. S. · Nature · 2009 · 459 · 7310.1038/nature07971 ↗
33. Douglas S. M. · Nature · 2009 · 459 · 41410.1038/nature08016 ↗
34. Ke Y. · J. Am. Chem. Soc. · 2009 · 131 · 1590310.1021/ja906381y ↗
35. Ke Y. · Nano Lett. · 2009 · 9 · 244510.1021/nl901165f ↗
36. Li Z. · J. Am. Chem. Soc. · 2010 · 132 · 1354510.1021/ja106292x ↗
37. Zhao Z. · Nano Lett. · 2011 · 11 · 299710.1021/nl201603a ↗
38. Heilemann M. · J. Am. Chem. Soc. · 2004 · 126 · 651410.1021/ja049351u ↗
39. Heilemann M. · J. Am. Chem. Soc. · 2006 · 128 · 1686410.1021/ja065585x ↗
40. Hannestad J. K. · J. Am. Chem. Soc. · 2008 · 130 · 1588910.1021/ja803407t ↗
41. Hannestad J. K. · Small · 2011 · 7 · 317810.1002/smll.201101144 ↗
42. Dutta P. K. · J. Am. Chem. Soc. · 2011 · 133 · 1198510.1021/ja1115138 ↗
43. He Y. · Nat. Nanotechnol. · 2010 · 5 · 77810.1038/nnano.2010.190 ↗
44. Voigt N. V. · Nat. Nanotechnol. · 2010 · 5 · 20010.1038/nnano.2010.5 ↗
45. Gu H. · Nature · 2010 · 465 · 20210.1038/nature09026 ↗
46. Wilner O. I. · Nat. Nanotechnol. · 2009 · 4 · 24910.1038/nnano.2009.50 ↗
47. Steinhauer C. · Angew. Chem. · 2009 · 48 · 887010.1002/anie.200903308 ↗
48. Ding B. · J. Am. Chem. Soc. · 2010 · 132 · 324810.1021/ja9101198 ↗
49. Stein I. H. · J. Am. Chem. Soc. · 2011 · 133 · 419310.1021/ja1105464 ↗
50. Kuzyk A. · Nature · 2012 · 483 · 31110.1038/nature10889 ↗
51. Shen X. · J. Am. Chem. Soc. · 2011 · 134 · 14610.1021/ja209861x ↗
52. Lin C. · Angew. Chem. · 2007 · 46 · 608910.1002/anie.200701767 ↗
53. Kershner R. J. · Nat. Nanotechnol. · 2009 · 4 · 55710.1038/nnano.2009.220 ↗
54. Ding B. · Nano Lett. · 2010 · 10 · 506510.1021/nl1033073 ↗
55. Becerril H. A. · Small · 2007 · 3 · 153410.1002/smll.200700240 ↗
56. Surwade S. P. · J. Am. Chem. Soc. · 2011 · 133 · 1186810.1021/ja2038886 ↗
57. Frykholm K. · Nucleic Acids Symp. Ser. · 2008 · 46510.1093/nass/nrn236 ↗
58. Frykholm K. · Langmuir · 2009 · 25 · 160610.1021/la8032513 ↗
59. Stengel G. · J. Am. Chem. Soc. · 2007 · 129 · 958410.1021/ja073200k ↗
60. Gunnarsson A. · Nano Lett. · 2008 · 8 · 18310.1021/nl072401j ↗
61. Banchelli M. · J. Phys. Chem. B · 2008 · 112 · 1094210.1021/jp802415t ↗
62. Jakobsen U. · J. Am. Chem. Soc. · 2008 · 130 · 1046210.1021/ja8030054 ↗
63. Chan Y. H. · Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. · 2009 · 106 · 97910.1073/pnas.0812356106 ↗
64. Dave N. · ACS Nano · 2011 · 5 · 130410.1021/nn1030093 ↗
65. Yoshina-Ishii C. · J. Am. Chem. Soc. · 2003 · 125 · 369610.1021/ja029783+ ↗
66. Pfeiffer I. · J. Am. Chem. Soc. · 2004 · 126 · 1022410.1021/ja048514b ↗
67. Chan Y. H. · Biointerphases · 2008 · 3 · FA1710.1116/1.2889062 ↗
68. Tumpane J. · Chem. Phys. Lett. · 2007 · 440 · 12510.1016/j.cplett.2007.04.018 ↗
69. Sandin P. · J. Phys. Chem. C · 2008 · 112 · 1308910.1021/jp801790c ↗
70. Sandin P. · J. Phys. Chem. C · 2009 · 113 · 594110.1021/jp808239a ↗
71. Lundberg E. P. · Chem. Commun. · 2010 · 46 · 371410.1039/c001513j ↗
72. Borjesson K. · J. Am. Chem. Soc. · 2009 · 131 · 283110.1021/ja8038294 ↗
73. Borjesson K. · ACS Nano · 2010 · 4 · 503710.1021/nn100667b ↗
74. Borjesson K. · Chem. Commun. · 2012 · 48 · 179310.1039/c2cc17434k ↗
75. Borjesson K. · Angew. Chem. · 2011 · 50 · 831210.1002/anie.201103338 ↗
76. Czolkos I. · Nano Lett. · 2009 · 9 · 248210.1021/nl901254f ↗
77. Tristram-Nagle S. · Biophys. J. · 1998 · 75 · 91710.1016/S0006-3495(98)77580-0 ↗
78. Ardhammar M. · Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. · 2002 · 99 · 1531310.1073/pnas.192583499 ↗
79. Nordén, B.; Rodger, A.; Dafforn, T.Linear Dichroism and Circular Dichroism: A Textbook on Polarized-Light Spectroscopy;Royal Society of Chemistry:Cambridge, U.K.: 2010; p293.10.1039/9781839168932 ↗
80. Matsuoka Y. · Biopolymers · 1982 · 21 · 243310.1002/bip.360211208 ↗
81. Matsuoka Y. · Biopolymers · 1983 · 22 · 173110.1002/bip.360220709 ↗
82. Svensson F. R. · J. Phys. Chem. B · 2007 · 111 · 1083910.1021/jp072890b ↗